本院透過智財保護與技術移轉，致力於將研究人員利用公共資金研發之智識成果，轉化為能滿足實際社會需求的應用，以回饋社會造福人群，甚而提升我國際競爭力。為達成上述任務，本院除就具有社會應用潛力之研發成果，採行適當的智財保護手段外，亦積極促成學研界與業界間之互動與合作。
本院在保護及管理研發成果時，除運用著作權、營業秘密及商標權等法律保護外，最常選擇的智財保護手段，是將具有產業利用性、新穎性及進步性之成果申請專利。
在推廣應用性科學研究發展成果時，本院主要藉由專屬授權或非專屬授權、材料移轉及合作委託研究之產學合作等方式，將基礎科學研究成果轉化為具社會價值之產出。
| 智財保護組介紹 | 資助研究計畫組介紹 | 商業開發暨授權組介紹 | 履約管理組介紹 |
各組業務說明：
智財組負責院內研究成果的智慧財產權（如專利、商標等）申請、維護及管理。此外，智財組還為研究人員提供智慧財產保護的建議與諮詢。
智財組期望能協助研究人員在研究計畫初期即進行專利申請規劃，以確保保護內容與市場需求相符。宣導避免在未提出專利申請前公開研究成果，以保護創新性。定期監測市場趨勢以調整智財策略。採用專利、商標和著作權等多種保護方式，形成全面的智財保護網。
資助組負責本院與廠商間之資助研究計畫業務及MTA in業務。
中央研究院長期推動學術研究成果的產學合作，但過去的合作/委託研究模式中的智財權歸屬常常不明確，影響成果轉化和價值實現。為解決此問題，本院重新檢視相關規範，推出新的資助研究計畫模式，將合作和委託研究融合，並依據「中央研究院接受資助研究計畫作業要點」制定契約指導原則，依照知識貢獻分配研究成果，保障研究人員權益，提升成果應用價值。
傳統模式下，研究成果歸屬主要依經費投入比例決定，容易導致外部單位取得智識產權，並模糊合作與委託研究界線，引發爭議。新作業要點明確規定智財權歸屬原則，提供靈活的合作模式，透過專業評估保障研究團隊成果，促進商業化。此外，本組亦協助辦理研究材料移入相關契約，以協助完善其研究。
商業開發暨授權組負責本院技術授權業務。
透過取得本院技術之授權運用，廠商得以將領先全球的最新研究成果，實施於其創新商品開發，有助於縮短內部研發時間、節省研發成本，藉以提高產品品質，改進生產流程，提高廠商全球市場競爭力，推動業務持續成長。
在商業開發上，我們透過市場分析與產業需求評估，協助實驗室研究方向參考市場趨勢，提升研究成果的應用潛力，使研究成果更符合社會及市場需求。我們主動尋找潛在授權對象，推廣研發成果，包括舉辦技術說明會、參與產業展覽，將本院的研究成果轉化為具市場價值的產品。
在技術移轉政策上，本院傾向於降低初始階段(先期)授權金金額，廠商可快速取得實施機會，不須於開發初期墊付高額的代價，並有彈性授權期限，以減輕取得技術之成本負擔。最終目的在於藉由提高研發成功機率(降低研發風險)，鼓勵廠商投入，以提升產業競爭力，落實技術商品化，造福廣大社會群眾。
本院也致力於擴大研發成果的擴散綜效，在授權策略上，除須重度資源投入的技術開發案件，例如生技醫藥、替代能源等，可考慮專屬授權，研發成果以非專屬授權(授權多家廠商使用)為主要手段，較為符合本院作為政府機關期待技術普及與公共利益的宗旨。本院另有試運作模式(僅限使(試)用之短期非專屬授權，不得商化)，供廠商快速測試，檢驗本院技術之效能，提供更有彈性的技術授權方案。
履約管理組負責本院授權、材料移轉及營利事業資助研究計畫等契約的應收款項(包括現金和股票)的收款與分配，以及創作人申請獲配股票緩課稅資格認定等業務。此外，我們也負責包含定期追蹤專屬授權技術的開發進度，及管理本院因權益收入而獲配的股權，並負責相關的處分事宜。
綜合規劃組專責智財技轉處的行政支援與政策規劃業務，涵蓋法務、會計、總務、人事及文書等業務，確保各項行政作業順利運行。我們同時協助院內智財與技術移轉政策的制定，推動相關法規的建立與修正，並負責各類技術移轉、資助研究契約審閱，確保契約內容符合本院政策目標。